| チーム名 | 順位 | 選手名 | 守備 | 出身 |
|---|---|---|---|---|
| 中日 | 希望 | 田中大輔 | 捕手 | 東洋大 |
| 3 | 浅尾拓也 | 投手 | 日本福祉大 | |
| 4 | 菊地正法 | 投手 | 東邦ガス | |
| 5 | 岩崎達郎 | 内野手 | 新日本石油ENEOS | |
| 6 | 清水昭信 | 投手 | 名城大 | |
| 7 | 西川明 | 内野手 | 法政大 | |
| (1) | 堂上直倫 | 内野手 | 愛工大名電高 | |
| (3) | 福田永将 | 捕手 | 横浜高 | |
| 阪神 | 希望 | 小嶋達也 | 投手 | 大阪ガス |
| 3 | 上園啓史 | 投手 | 武蔵大 | |
| 4 | 清水誉 | 捕手 | 関西学院大 | |
| 5 | 大城祐二 | 内野手 | TDK千曲川 | |
| (1) | 野原将志 | 内野手 | 長崎日大高 | |
| (3) | 橋本良平 | 捕手 | 智弁和歌山高 | |
| (4) | 横山龍之介 | 投手 | 日本文理高 | |
| ヤクルト | 希望 | 高市俊 | 投手 | 青山学院大 |
| 3 | 西崎聡 | 投手 | JR北海道 | |
| 4 | 衣川篤史 | 捕手 | 住友金属鹿島 | |
| (1) | 増渕竜義 | 投手 | 鷲宮高 | |
| (3) | 上田剛史 | 外野手 | 関西高 | |
| (4) | 山田弘喜 | 投手 | 城東工高 | |
| 育成1 | 伊藤秀範 | 投手 | 四国リーグ・香川 | |
| 巨人 | 希望 | 金刃憲人 | 投手 | 立命館大 |
| 3 | 上野貴久 | 投手 | NTT東日本 | |
| 4 | 円谷英俊 | 内野手 | 青山学院大 | |
| 5 | 深沢和帆 | 投手 | 四国リーグ・香川 | |
| 6 | 寺内崇幸 | 内野手 | JR東日本 | |
| 7 | 深町亮介 | 投手 | 中京大 | |
| (1) | 坂本勇人 | 内野手 | 光星学院高 | |
| (3) | 田中大二郎 | 内野手 | 東海大相模高 | |
| (4) | 伊集院峰弘 | 捕手 | 鹿児島実高 | |
| 育成1 | 鈴木誠 | 投手 | ＪＲ東日本 | |
| 育成2 | 下山学 | 外野手 | 青森大 | |
| 育成3 | 松本哲也 | 外野手 | 専修大 | |
| 育成4 | 隠善智也 | 外野手 | 広島国際学院大 | |
| 育成5 | 芦沢明 | 内野手 | 前シダックス | |
| 育成6 | 作田啓一 | 外野手 | 苫小牧駒澤大 | |
| 育成7 | 大抜亮祐 | 投手 | 中京高 | |
| 広島 | 希望 | 宮崎充登 | 投手 | ホンダ鈴鹿 |
| 3 | 上野弘文 | 投手 | トヨタ自動車 | |
| 4 | 青木高広 | 投手 | 日産自動車 | |
| 5 | 中東直己 | 外野手 | ホンダ鈴鹿 | |
| (1) | 前田健太 | 投手 | PL学園高 | |
| (2) | 会澤翼 | 捕手 | 水戸短大付高 | |
| 育成1 | 山中達也 | 投手 | 丸亀城西高 | |
| 横浜 | 希望 | 高崎健太郎 | 投手 | 日産自動車 |
| 3 | 木村雄太 | 投手 | 東京ガス | |
| 4 | 下園辰哉 | 外野手 | 九州国際大 | |
| 5 | 下窪陽介 | 外野手 | 日本通運 | |
| 6 | 吉原道臣 | 投手 | ホンダ | |
| (1) | 北篤 | 投手 | 小松工高 | |
| (3) | 梶谷隆幸 | 内野手 | 開星高 | |
| (4) | 高森勇気 | 捕手 | 中京高 | |
| 日本ハム | 希望 | 宮本賢 | 投手 | 早稲田大 |
| 3 | 糸数敬作 | 投手 | 亜細亜大 | |
| 4 | 長野久義 | 外野手 | 日本大 | |
| 5 | 山本一徳 | 投手 | 早稲田大 | |
| 6 | 金子洋平 | 外野手 | ホンダ | |
| 7 | 今浪隆博 | 内野手 | 明治大 | |
| 8 | 内山雄介 | 投手 | 旭川大 | |
| (1) | 吉川光夫 | 投手 | 広陵高 | |
| (3) | 植村祐介 | 投手 | 北照高 | |
| (4) | ダース・ ロマーシュ匡 |
投手 | 関西高 | |
| ソフトバンク | 希望 | 大隣憲司 | 投手 | 近畿大 |
| 3 | 高谷裕亮 | 捕手 | 白鴎大 | |
| 4 | 森福允彦 | 投手 | シダックス | |
| 5 | 長谷川勇也 | 外野手 | 専修大 | |
| 6 | 川頭秀人 | 投手 | 福岡大 | |
| (1) | 福田秀平 | 内野手 | 多摩大聖ヶ丘高 | |
| (3) | 伊奈龍哉 | 内野手 | 近江高 | |
| (4) | 李秉諺 | 内野手 | 岡山共生高 | |
| 育成1 | 山田大樹 | 投手 | つくば秀英高 | |
| 西武 | 希望 | 岸孝之 | 投手 | 東北学院大 |
| 3 | 山本淳 | 投手 | TDK千曲川 | |
| 4 | 原拓也 | 内野手 | 関東学院大 | |
| 5 | 岩崎哲也 | 投手 | 三菱重工横浜硬式野球クラブ | |
| 6 | 大崎雄太朗 | 外野手 | 青山学院大 | |
| (1) | 木村文和 | 投手 | 埼玉栄 | |
| (3) | 朱大衛 | 投手 | 中部大一高 | |
| ロッテ | 3 | 神戸拓光 | 外野手 | 流通経済大 |
| 4 | 荻野忠寛 | 投手 | 日立製作所 | |
| 5 | 江口亮輔 | 投手 | 愛知学院大 | |
| 6 | 中郷大樹 | 投手 | JR四国 | |
| 7 | 角中勝也 | 外野手 | 四国リーグ・高知 | |
| 8 | 松本幸大 | 投手 | デュプロ | |
| (1) | 大嶺祐太 | 投手 | 八重山商工高 | |
| (2) | 佐藤賢治 | 外野手 | 横浜高 | |
| (3) | 黒滝将人 | 投手 | 札幌日大高 | |
| オリックス | 希望 | 小松聖 | 投手 | JR九州 |
| 3 | 大引啓次 | 内野手 | 法政大 | |
| (1) | 延江大輔 | 投手 | 瀬戸内高 | |
| (3) | 梅村学人 | 投手 | 三重高 | |
| (4) | 仁藤拓馬 | 投手 | 島田商高 | |
| (5) | 土井健大 | 捕手 | 履正社高 | |
| 楽天 | 1 | 永井怜 | 投手 | 東洋大 |
| 3 | 嶋基宏 | 捕手 | 国学院大 | |
| 4 | 横川史学 | 外野手 | 青山学院大 | |
| 5 | 渡辺直人 | 内野手 | 三菱ふそう川崎 | |
| (1) | 田中将大 | 投手 | 駒大苫小牧高 | |
| (3) | 山本大明 | 捕手 | 尾山台高 | |
| 育成1 | 金森久朋 | 投手 | 西多摩クラブ | |
| 育成2 | 中村真人 | 外野手 | シダックス |